Vários milhares de anos depois de um fenômeno misterioso transformar toda a humanidade em pedra, o garoto extraordinariamente inteligente, orientado pela ciência, Senku Ishigami, acorda da petrificação. Enfrentando um mundo de pedra e o colapso total da civilização, Senku decide usar a ciência para reconstruir o mundo. Começando com seu super forte amigo de infância Taiju Oki, que despertou ao mesmo tempo, eles começarão a reconstruir a civilização do nada. Retratando dois milhões de anos de história científica desde a Idade da Pedra até os dias atuais, a história de aventura de artesanato sem precedentes está prestes a começar.
